报告时间：12月6号9:30
报告地点：数学院一楼报告厅
报告人：朱媛
报告摘要：简述概率图模型、图小波方法在蛋白质相互作用网络的重构问题、蛋白质相互作用的复合物挖掘研究工作。详细介绍概率图模型在单细胞数据中的应用和分析，包括在图像表示的单细胞数据分析和处理中，通过非参数统计量初步筛选野生型和突变型的单细胞基因表达数据；融合敲除基因、蛋白质-DNA 相互作用数据（PDI）和基因相互作用（GI 数据）数据，得到基因之间的因果调控（激活抑制）关系；由PPI 和PDI 数据融合构建蛋白质相互作用网络，并用所建立的稀疏概率图模型得到网络中路径的权重。最后，通过推断路径的整合，在细胞层次上重建信号网络。推断出细胞层面多个显著基因例如lit-1、pop-1、wrm-1 等对基因nhr-25（线虫皮肤组织形成的关键基因）的调控作用，其推断结果不仅包括网络的调控方向，还包括基因的抑制（-）或激活（+）功效。其次，对于scRNA-seq型的单细胞数据，考虑到现有的聚类方法对于区分细胞的类别有一定的局限性，我们利用概率图模型的方法实现集成聚类，其算法具有一定的有效性且不依赖于初始的聚类数目。
报告人简介：朱媛，中国地质大学自动化学院副教授。2009年毕业于河南大学数学与信息科学学院，获理学硕士学位。2012 年毕业于中山大学数学学院，获得理学博士学位。2014 年-2015 年在香港城市大学科学与工程学院进行博士后研究工作。2015年进入中国地质大学（武汉）自动化学院工作。主要研究方向包括生物分子网络建模与分析，统计模式识别，生物组学数据分析和处理等。目前，主持和完成国家自然科学基金青年基金，湖北省，广东省自然科学基金3 项，作为主要参与人参加国家自然科学基金面上项目2项，在Bioinformatics，Pattern Recognition，IEEE TCBB，BMC Bioinformatics 等生物信息领域重要期刊上发表论文10 余篇。
