题    目：空间生物学的智能解码、集成与生成

主讲人：张世华   研究员

单    位：中国科学院数学与系统科学研究院

时    间：7月6日   9:30

地    点：学院南阶梯教室

摘    要：空间转录组学的技术进步对于更好地理解生物研究中组织的结构和功能至关重要。人工智能算法与空间转录组学的结合为破译组织结构提供了有效途径。我们团队开发了STA-系列空间转录组学AI工具,比如STAGATE和STAligner。最近，我们提出了空间多组学整合工具STAMO、定向或时变基因检测工具STAVAG，空间转录组学的高保真模拟和全视图3D建模工具STADiffuser，跨物种空间转录组集成工具STACAME，以及空间组学可扩展通用解析工具STAX。在这次报告中，我将以其中的典型算法和工具为例，介绍如何利用深度学习有效地建模空间转录组学数据，并用以解决生物学中的关键问题。

简    介：张世华，中国科学院数学与系统科学研究院研究员。主要从事生物信息学与计算生物学、人工智能理论与算法研究，特别是(1) 单细胞与空间组学的智能表征、集成与建模，以及在复杂疾病、发育和进化等领域的应用 (Nature Genetics, Nature Computational Science, Nature Communications, Cell Genomics, Cell Systems等); (2) 三维基因组计算解析与应用 (Cell, Advanced Science, Genome Research); (3) 人工智能基础理论与算法设计(JMLR, IEEE TPAMI, National Science Review等)。曾获中国青年科技奖、中创软件人才奖、教育部自然科学奖二等奖（第三）、中国生物信息学十大进展（两次）、中科院卢嘉锡青年人才奖、全国百篇优秀博士论文奖等。现担任PLOS Computational Biology的Section Editor和Genomics, Proteomics & Bioinformatics编委。