报告题目：离子溶液中RNA空间结构及其稳定性预测
主 讲 人：时 亚 洲
单 位：武汉纺织大学数学与计算机学院
时 间：8月31日15:00
腾 讯 ID：544 563 609
密 码：123456
摘 要：
RNA是一类非常重要的生物大分子，其空间结构及结构稳定性对诸多生物功能的发挥（如调控基因的表达和催化生物化学反应等）至关重要。因此，了解RNA的空间结构及其稳定性是理解其功能的先决条件，并且可以为计算机辅助药物设计提供指导。由于RNA带有高密度的负电荷，其结构的折叠高度依赖溶液中的盐离子，然而现有的RNA结构预测方法基本都忽略了离子对RNA折叠的影响。于是，我们提出了一个新的RNA粗粒化模型以预测RNA在离子溶液中的空间结构及其稳定性。基于隐含离子模型和Monte Carlo模拟退火算法，我们的模型不仅能够成功地从序列预测RNA分子（包括RNA发夹、RNA双链、RNA赝结、RNA“接吻”复合体等）的空间结构（RMSD<6Å），而且还能够定量地预测长度/序列各异的RNA分子在广泛离子条件下的热力学稳定性。除此之外，针对典型的RNA三级结构单元（RNA赝结和RNA“接吻”复合体），我们的模型能预测出与实验结果一致的去折叠路径，并且分析表明RNA分子的去折叠路径可以通过改变序列和离子条件来进行调控。
简 介:
时亚洲，武汉纺织大学数学与计算机学院副教授，2019年入选湖北省“楚天学者计划”。2015年博士毕业于武汉大学物理科学与技术学院，师从谭志杰教授从事生物物理方向的研究。目前，主要研究方向为生物大分子（如RNA）的空间结构预测及分子设计、生命系统的数学/物理建模和复杂疾病（如肿瘤）的发病机理等。在国际主流SCI期刊（如PLOS Computational Biology、Biophysics Journal、Journal of Chemical Physics、RNA等）上发表论文近二十篇，主持国家自然科学基金项目、湖北省科技厅面上项目、湖北省教育厅人才项目各1项，并参与国家级及省部级项目多项。
